《免疫信息学原理及其应用》内容包括免疫生物学基础、免疫系统功能模建、免疫信息学数据和数据挖掘、B细胞表位的预测、T细胞表位的预测、抗原处理与TAP转运预测、感染性疾病的传播动力学及免疫流行病学模型、抗病毒疫苗研发、反向疫苗学在细菌疫苗中的应用、免疫信息学在抗原虫病疫苗研发中的应用、抗蠕虫疫苗研发、免疫信息学和抗肿瘤疫苗的研发、生物信息学在抗自身免疫病疫苗研发中的应用、免疫信息学在实验与临床免疫学中的应用。