《日本古典文学大辞典》的编撰方针是：立足本国学界，强调个案研究。所谓立足本国学界，就是一要如前所述为国内的本专业及一般人文学界服务，二要体现中国研究者的视角。为此不仅在作品的分析上点出我国文学的影响关系，还在整体的条目选择到具体的撰述中尽量体现中日比较研究的特色，使得读者通过阅读本辞典，既可以了解日本古典文学，还可以以日本古典文学为参照或反照，重新或加深理解本国的文学作品。
本辞典的内容分为四部分：（1）人物与作品解题、（2）文学概念、（3）基础知识、（4）附录。第一部分的“人物与作品解题”把各个时代的人物和作品分为S、A、B三类。第二部分的“文学概述”中包括了“文学体裁”、“集体性文学活动”、“术语解释”等内容，通过举例说明，使初学者也能够具体领会。第三部分的“基础知识”包括“自然环境”、“生活空间”、“典章制度”、“天文占卜”、“宗教信仰”、“外来文化”，力求较为完整地介绍日本的古代文化。第四部分为“附录”为（1）后宫与官职制度概要、（2）中日对照文学史年表。
所立条目共一千一百余条，所涉及时代以近世为下限，也有明治时期的条目。