《台湾秘密档案解密》讲述了：半个多世纪以来，国共两党及海峡两岸一直处于紧张对峙状态。在此期间，发生了许多重大政治、历史事件，直接或间接影响到中国历史及两岸关系的发展走向。但在那个非常年代，由于众所周知的原因，这些历史大都封存在秘密档案里以及当事人的记忆中，鲜为人知。