《全国高等医学院教材·病原生物学(第3版)》分为绪论、上卷医学微生物学和下卷医学寄生虫学三部分，包括细菌学、病毒学、真菌学、蠕虫学、原虫学及医学节肢动物学六篇，计45章。《全国高等医学院教材·病原生物学(第3版)》阐述了各类病原生物的生物学性状、致病性和免疫性、病原学诊断方法和防治原则，并着重阐述各类病原生物引起的感染过程和机体抗感染免疫的机制、遗传变异的原理和消毒灭菌的基础知识及其应用。《全国高等医学院教材·病原生物学(第3版)》对细菌、病毒、真菌、蠕虫、原虫和节肢动物六大类病原生物，从对比的角度，阐明了各自的基本特性与区别，既为学习后续课程打下了基础，又为今后的临床实践提供了指南。对于近来进展飞速、对病原生物学有着重大影响的新知识及新现和再现的病原体予以补充阐述。