《基因表达分析手册:方法的实用性及其缺陷》代表了全世界200多位基因表达分析领域研究者的集体成就，全面阐述了几乎每一种分析基因表达的技术和方法，不仅包括转录、转录后、翻译和翻译后水平基因表达的基本背景知识，还包括每种方法的实验程序以及均衡的、无偏的处理，并尽可能多地囊括了当前可以利用的网络资源，真可谓现代生物学中这一领域的百科全书。
《基因表达分析手册:方法的实用性及其缺陷》内容包括基因表达的基础理论、样品制备方法、mRNA的高通量表达方法、蛋白质的表达分析、mRNA和蛋白质的原位及体内分析等，并对生物信息工具和计算机分析方法做了重点介绍。