《农业污染治理政策分析》共分七章。第一章介绍了农业污染问题产生的背景，指出了农业污染治理的紧迫性和必要性；第二章描述了中国农业污染的现状，并从政策、经济和技术三个方面简要分析了农业污染形成的原因；第三章从最优污染理论出发对农业污染治理政策进行了理论探讨，回顾了一般污染治理政策形成的思路，构建了农业污染治理的政策矩阵；第四章对农业污染治理政策进行了分类研究，论证了各种农业污染治理政策手段组合运用的必要性和可行性；第五章介绍了美国和欧盟的农业污染治理情况，分析了各种政策手段综合运用的实际效果，总结了农业污染治理的国际经验；第六章对中国现行农业污染治理政策进行了分析；第七章根据上述研究和分析，提出了相应的政策建议。
作者从环境经济学、福利经济学、公共选择理论和公共政策分析等角度，采取规范研究与实证研究相结合的方法，对农业污染治理政策进行了分析。作者指出，只有实现农业一环境政策一体化，构建农业污染治理综合决策机制，组合运用法律规制、经济激励和自主参与等政策工具，发挥政府、市场和社会的优越性，调动各方面的力量，才能有效地治理农业污染。