《柯半仙传奇》将太安堂近500年历十三代传承下来的中医理法方药等珍贵文化遗产、太安堂发展历程、传统哲学和各中医药经典名著等相关资料进行整理编纂。循五行相生机制，按医、药、史、鼎、新五部十五类编排。其中“医部”分“经典、秘典”二类；“药部”分“药苑、名药”二类；“史部”分“渊源、传奇、复兴”三类，“鼎部”分“基石、讲坛、文治”三类；“新部”分“立德、立功、画卷、立业、立言”五类。共五部十五类，一百零八卷。