《萨迦世系史》的内容主要分五个部分，即，光明天界之世系；无垢昆氏家庭之世系；由萨迦昆氏家庭分出的四个拉章之世系；其他部分即萨迦历法任法座亦称历任达饮。在叙述这些内容时，作者主要依据大学者贡觉伦珠所著的《萨迦世系史——贤者口饰》，同时参考了尊胜萨迦派历辈祖师的传记，特别是至尊索南孜摩所著的诗体世系史等多种必备的著作、塔巴贡噶扎所著的世系史、喇嘛塔巴之亲炙弟子西饶多杰所著的世系史、藏强巴多杰坚赞所著的世系史等史籍，还补充了许多上师口头的传说，编成一部可靠的著作。由于《萨迦世系史》叙述了西藏佛教各大宗教派中主要的一支萨迦派历辈大德的身世及其要政教两方面的业绩，特别是反映了当时西藏各方势力从各据一方的分裂状态起向统一，以及汉、藏、蒙古各族人民增强团结为祖国统一作出重大贡献的历史情况，成为学习历史、研究历史的人们不可缺的资料。