《双重起源与制度生成:中国现代大学制度起源研究》是一项探究中国现代大学制度起源的研究。作者樊艳艳通过对中国传统书院转制、新式大学对西方大学制度的引进等一系列具体活动的分析，剖析了在看似“外来移植”的发展轨迹下，中国现代大学制度的起源发展，以及特定历史时期中国传统教育机构如何被纳入现代学制系统，并在中西结合上尝试创造性转化，进而保持了中国传统高等教育的连续性。《双重起源与制度生成:中国现代大学制度起源研究》的特色在于围绕“李约瑟之谜”与“西方冲击论”两个概念及其在制度分析中所引出的激烈争论，独到地提出了中国现代大学制度双重起源这一主题。

引论
第一章 中国现代大学制度的起源基础
第一节 中国现代大学制度起源的历史性基础
第二节 中国现代大学制度起源的现实性基础
第二章 中国现代大学制度的起源路径
第一节 新式学堂或学校的制度移植
第二节 传统高等教育向现代大学的转型
第三章 中国现代大学学术自由制度之创建
第一节 西方学术自由的发展历程及其导入
第二节 学术自由在中国大学的形成与发展
第三节 对中国早期学术自由历程的总结与反思
第四章 中国现代大学自治制度之创建
第一节 中国传统教育机构的治校模式
第二节 西方教育理念的导引下中国大学自治的初步实现
第三节 对中国现代大学制度创制期大学自治的总结与反思
第五章 中国现代大学学科制度的形成
第一节 传统学科的自身演化及向现代转型
第二节 西学影响下大学学科体系的初步形成
第三节 传统学术的现代转型促成现代大学学科体系的形成
第四节 现代大学学科制度的百年反思
第六章 中国现代大学制度起源的理论分析
第一节 制度主义视阈内的教育变迁
第二节 对西方中心论及派生观点的驳斥
第三节 有关中国现代大学制度起源的不同观点
结语
主要参考文献
后记