《海峡两岸农业经贸关系研究》共分五章内容，第一章阐述了开展两岸农业经贸关系研究的目的、意义及研究内容和方法；第二章分析了两岸农业经贸关系发展的基础；第三章从两岸之间及两岸面对国际市场两个方面，分析了两岸农产品贸易关系的现状、问题及对策；第四章从农业投资的角度，探讨了农业投资在两岸农业经贸关系发展中的地位和作用，以及从区域分布和产品结构两个方面实证分析了台商在大陆进行农业投资的发展特征；第五章重点从两岸农业经贸关系发展所面临的机遇和挑战以及优劣势条件出发，分析了两岸农业经贸关系发展的战略环境，提出了相应的对策建议。