《浦东综合配套改革的理论与实践》分为十二章，第一章制度系统与综合配套改革；第二章浦东综合配套改革的缘起；第三章浦东综合配套改革的基本内容与总体进展；第四章浦东综合配套改革与服务型政府建设；第五章浦东综合配套改革与消除城乡二元结构；第六章浦东综合配套改革与区域创新体系建设；第七章浦东综合配套改革与社会中介组织的培育等等。