《生物工程专业综合素质培养型系列教材:生物工程制药学》共有十三章，可概括为三部分：第一章是绪论篇，介绍国内外生物工程制药发展的历史和现状；第二章到第七章是原理和工艺篇，具体介绍生物工程制药的主要原理、基本概念及工艺基础；第八章到第十三章为药物篇，具体介绍疫苗、抗体药物等。《生物工程专业综合素质培养型系列教材:生物工程制药学》既关注生物分离的主要技术和相关原理，又重点阐述了生物工程制药技术的基础理论、基本知识和基本技能。