晋代的《针灸甲乙经》是我国第一部针灸专著。它继承了《内经》中脑为阳的六经理论和卫气理论，也吸纳了营气理论。皇甫谧在该书的总论中收录了“十二经脉”，但没有用它去串联全身穴位。
元代的《十四经发挥》对后世的针灸理论影响很大。作者滑寿把“十二经脉”正式当做全身穴位的连线。这种变化看起来似乎是针灸理论的进步，然而却是不幸的倒退；因为它把先进的刺穴疗法的理论倒退到古老的刺脉疗法的时代去了。
针灸理论出现这种变化的原因虽然很复杂，但其中有可能与当时药物疗法在医疗中占有绝对的优势有关，因为做为药物疗法支柱的藏府论并不重视脑的地位和作用。特别是唐朝的王冰在《黄帝内经素问》中片面支持了脑为“奇恒之府”和“脑为阴”的观点，从根本上动摇了《针灸甲乙经》的理论基础。尽管后来《十四经发挥》取代了《针灸甲乙经》的地位，但是它对针灸的l临床实践并无多大影响。在本书中作者考察了几个病证历代手足十二经取穴的演变，确信直至现代，指导针灸实践的一直是《针灸甲乙经》。
王齐亮编著的《中医针灸理论刍议》揭示了《黄帝内经》中存在而长期被人忽视的有关脑为阳的六经理论，并对“十二经脉”的内容进行了认真、仔细的剖析。“十二经脉”是一篇极重要的、阐明脑为人体最高主宰的著作，可惜后世医家没能领会其最宝贵的理论核心。
《中医针灸理论刍议》还揭示了《内经》中存在有关人体神经结构的记载，对《灵枢·经筋篇》进行了分析和论证。通过对“十二经脉”和《灵枢·经筋篇》的探讨，可知在世界医学发展史上，最早发现人体血液循环的是中医，最早提出神经论的也是中医。
根据以上考证，本书作者对《中医学概论》(1959版)以及有关中医和针灸理论的现状和继承、发展问题提出了相关建议。