《国学复兴论》以“国学复兴”为中心展开论述，分为绪论、上编和下编三部分。“绪论”主要阐述关于国学内涵与国学复兴的基本问题，包括“国学正名”“五四精神”“旧邦新命”“国有与立”“天下为公”和“保合太和”等诸多热点、重点、难点与疑点问题：上编“国学之魂”主要论述了国学中最为重要的几大精神传统，包括传统宗教（天祖教）、老子、孔子、墨子与慧能等精神传统。这些精神传统构成了“国学之魂”；下编“文化自觉”主要评述了梁启超、纪宝成、郭齐勇、陈来和王富仁关于国学内涵、国学教育、国学复兴等问题的基本观点，这些问题意识体现了“文化自觉”精神。这三部分内容既相对独立，又互相联系。