《雲自在龕随筆》系缪荃孙读书笔记。目前比较常见的是商务印书馆1958年排印本，四卷，分别是论史、书画、金石和书籍。山西古籍出版社1996年据此本进行点校并加小标题，汇入《民国笔记小说大观》之第一辑。在此之前，则有罗振玉辑刻《古学汇刊》第一集和第二集，先后收入《云自在龛笔记》一卷和《云自在龛笔记》六卷。一卷者即“书画”，其内容与商务印书馆《云自在龛随笔》中的“书画”互有异同。六卷者则全为“掌故”，分“列朝”、“顺治朝补记”、“康熙朝诸臣”等。《云自在龛随笔》还有两种稿本，一是北京大学图书馆藏缪荃孙之子缪僧保（子彬）手抄六卷（以下简称抄稿本）。有“掌故”、“论史”、“书籍”、“金石”、“书画”、“杂记”等。函套签题“云自在龛随笔原稿本”，首页钤有“小云堪”、“子彬手钞”等印。另一种即是现藏国家图书馆的《云自在龛随笔》作者手稿本（以下简称原稿本）。