《中国科技统计年鉴2009》内容分为八个部分：第一部分为全社会科技活动的综合统计资料；第二部分为地级及以上研究与开发机构科技活动统计资料；第三部分为大中型工业企业及高技术产业科技活动统计资料；第四部分是高等学校科技活动统计资料；第五部分为国家科技发展计划统计资料等。